万圣节到了，神秘公司的成员们：弗雷德、达芙妮、维尔玛、长毛和史酷比准备好好享受难得的假期。一起突发事件打乱了他们的计划并威胁到了参加万圣节游行车会的民众的安全。经过调查发现，幕后黑手竟是一个想要报复神秘公司的新敌人，而这个敌人异常的神秘和强大。为了找出这个幕后黑手并揭穿他的阴谋，神秘公司不得不与他们的宿敌——史酷比历史上每一个万圣节装扮背后的邪恶策划者——强纳森·克莱恩博士合作。当然，合作是有条件的。这个不可预测的新盟友给史酷比和他的朋友们带来了不少麻烦，不过他们也将学习到一些怪异的新技巧，甚至穿上他们最

一股邪恶的力量唤醒杀人小丑亚特。在万圣夜，杀人小丑亚特回到迈尔斯镇，他的目的是抓拿一名少女和她的弟弟，并在万圣夜当晚将他们两人杀害。小丑亚特杀人不眨眼，受害人数不断增加，姊弟两人为生存而奋战的同时也努力探查杀人小丑亚特背后的动机。